Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1CQ13936 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms