Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P11Q13670 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P11Q13670 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P11Q13670 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P11Q13670 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P11Q13670 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P11Q13670 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PMS2P11Q13670 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PMS2P11Q13670 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PMS2P11Q13670 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PMS2P11Q13670 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P11Q13670 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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