Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms