Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HDAC1Q13547 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC1Q13547 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
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