Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C1orf61Q13536 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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