Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LSAMPQ13449 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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