Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGCGQ13326 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGCGQ13326 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SGCGQ13326 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGCGQ13326 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGCGQ13326 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGCGQ13326 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGCGQ13326 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SGCGQ13326 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SGCGQ13326 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGCGQ13326 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SGCGQ13326 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGCGQ13326 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGCGQ13326 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGCGQ13326 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGCGQ13326 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGCGQ13326 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGCGQ13326 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGCGQ13326 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SGCGQ13326 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGCGQ13326 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGCGQ13326 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGCGQ13326 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGCGQ13326 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGCGQ13326 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SGCGQ13326 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SGCGQ13326 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGCGQ13326 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGCGQ13326 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SGCGQ13326 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SGCGQ13326 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGCGQ13326 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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