Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA3FQ13275 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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