Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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