Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPA4Q13156 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms