Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAA1Q13131 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAA1Q13131 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAA1Q13131 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAA1Q13131 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAA1Q13131 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAA1Q13131 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAA1Q13131 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAA1Q13131 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
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PRKAA1Q13131 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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PRKAA1Q13131 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
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PRKAA1Q13131 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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PRKAA1Q13131 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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PRKAA1Q13131 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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PRKAA1Q13131 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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PRKAA1Q13131 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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PRKAA1Q13131 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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PRKAA1Q13131 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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PRKAA1Q13131 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKAA1Q13131 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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PRKAA1Q13131 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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