Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXI1Q12951 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXI1Q12951 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXI1Q12951 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXI1Q12951 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXI1Q12951 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXI1Q12951 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXI1Q12951 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXI1Q12951 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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FOXI1Q12951 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXI1Q12951 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXI1Q12951 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXI1Q12951 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXI1Q12951 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXI1Q12951 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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