Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TROQ12816 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TROQ12816 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TROQ12816 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TROQ12816 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TROQ12816 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TROQ12816 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TROQ12816 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TROQ12816 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TROQ12816 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TROQ12816 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TROQ12816 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TROQ12816 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TROQ12816 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TROQ12816 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TROQ12816 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TROQ12816 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TROQ12816 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TROQ12816 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
TROQ12816 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TROQ12816 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TROQ12816 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TROQ12816 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TROQ12816 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TROQ12816 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TROQ12816 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TROQ12816 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TROQ12816 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TROQ12816 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TROQ12816 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TROQ12816 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TROQ12816 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TROQ12816 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TROQ12816 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TROQ12816 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TROQ12816 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TROQ12816 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TROQ12816 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TROQ12816 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TROQ12816 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TROQ12816 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TROQ12816 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TROQ12816 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TROQ12816 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TROQ12816 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TROQ12816 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TROQ12816 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TROQ12816 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
TROQ12816 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TROQ12816 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TROQ12816 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TROQ12816 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
TROQ12816 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
TROQ12816 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TROQ12816 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TROQ12816 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TROQ12816 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TROQ12816 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TROQ12816 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
TROQ12816 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TROQ12816 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TROQ12816 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TROQ12816 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TROQ12816 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TROQ12816 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TROQ12816 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TROQ12816 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TROQ12816 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TROQ12816 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TROQ12816 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TROQ12816 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TROQ12816 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TROQ12816 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TROQ12816 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TROQ12816 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TROQ12816 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TROQ12816 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TROQ12816 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TROQ12816 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TROQ12816 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TROQ12816 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TROQ12816 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TROQ12816 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TROQ12816 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TROQ12816 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TROQ12816 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TROQ12816 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TROQ12816 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TROQ12816 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TROQ12816 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TROQ12816 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TROQ12816 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TROQ12816 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TROQ12816 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TROQ12816 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TROQ12816 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TROQ12816 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TROQ12816 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TROQ12816 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TROQ12816 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
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