Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFEMP1Q12805 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFEMP1Q12805 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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