Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 KIN3YAR018C 1308 nt4.98□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 TRF5YNL299W 1929 nt4.98□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 CLB3YDL155W 1284 nt4.98□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 BCP1YDR361C 852 nt4.98□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 CIC1YHR052W 1131 nt4.98□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 TPK3YKL166C 1197 nt4.98□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 ECM23YPL021W 564 nt4.98□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 YPR170CYPR170C 336 nt4.98□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 MMT2YPL224C 1455 nt4.98□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 YCT1YLL055W 1596 nt4.98□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 SRS2YJL092W 3525 nt4.98□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 YTA6YPL074W 2265 nt4.98□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 CUE2YKL090W 1332 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 RDS2YPL133C 1341 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 YJL049WYJL049W 1353 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 ITT1YML068W 1395 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 YPD1YDL235C 504 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 YER187WYER187W 426 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 UPF3YGR072W 1164 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 YGR269WYGR269W 327 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 RPL8AYHL033C 771 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 YHR213WYHR213W 597 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 MAK16YAL025C 921 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 YAR062WYAR062W 597 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 RGS2YOR107W 930 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 DUN1YDL101C 1542 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt4.97□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 YND1YER005W 1893 nt4.96□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 YPS7YDR349C 1791 nt4.96□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 VPS30YPL120W 1674 nt4.96□□□□□ -1.61
MCD1Q12158 UGA3YDL170W 1587 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 GDS1YOR355W 1569 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 PBP4YDL053C 558 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 PHO13YDL236W 939 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 PEX10YDR265W 1014 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 SAE3YHR079C-A 276 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 DSE2YHR143W 978 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 YIL029CYIL029C 429 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 NFU1YKL040C 771 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 SRP21YKL122C 504 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 ATG10YLL042C 504 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 YNR042WYNR042W 429 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 RPA43YOR340C 981 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 DSN1YIR010W 1731 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 YPL109CYPL109C 1974 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 PCA1YBR295W 3651 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 BBC1YJL020C 3474 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 SYF1YDR416W 2580 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 THI7YLR237W 1797 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 ORC6YHR118C 1308 nt4.96□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 PDI1YCL043C 1569 nt4.95□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 YCR013CYCR013C 648 nt4.95□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 RCR2YDR003W 633 nt4.95□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 DPB4YDR121W 591 nt4.95□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 TFB3YDR460W 966 nt4.95□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 TAM41YGR046W 1158 nt4.95□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 YNL235CYNL235C 432 nt4.95□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 MSN1YOL116W 1149 nt4.95□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 ASM4YDL088C 1587 nt4.95□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 SEC4YFL005W 648 nt4.94□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt4.94□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 RSR1YGR152C 819 nt4.94□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.94□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 YPT7YML001W 627 nt4.94□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 RPL21BYPL079W 483 nt4.94□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 THS1YIL078W 2205 nt4.94□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 ARP5YNL059C 2268 nt4.94□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 RAD16YBR114W 2373 nt4.93□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 AVT1YJR001W 1809 nt4.93□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 YDL050CYDL050C 372 nt4.93□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 VAB2YEL005C 849 nt4.93□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 PUT2YHR037W 1728 nt4.93□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 HLJ1YMR161W 675 nt4.93□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 RPB5YBR154C 648 nt4.93□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 HCM1YCR065W 1695 nt4.92□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 THP1YOL072W 1368 nt4.92□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 DBP3YGL078C 1572 nt4.92□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 VPS33YLR396C 2076 nt4.92□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 MIG3YER028C 1185 nt4.92□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 NIT2YJL126W 924 nt4.92□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 BUR2YLR226W 1188 nt4.92□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 IGO1YNL157W 507 nt4.92□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 SOL1YNR034W 966 nt4.92□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 SEC27YGL137W 2670 nt4.92□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 ACK1YDL203C 1872 nt4.92□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 TFB2YPL122C 1542 nt4.92□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 NTA1YJR062C 1374 nt4.91□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 FUI1YBL042C 1920 nt4.91□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 YDR134CYDR134C 411 nt4.91□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 VPS74YDR372C 1038 nt4.91□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 BUD28YLR062C 378 nt4.91□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 snR10snR10 245 nt4.91□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 FYV12YOR183W 390 nt4.91□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 TOM5YPR133W-A 153 nt4.91□□□□□ -1.62
MCD1Q12158 PHR1YOR386W 1698 nt4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.3 ms