Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms