Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms