Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms