Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSRP1Q08945 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms