Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSME1Q06323 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSME1Q06323 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME1Q06323 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms