Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms