Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDSPL2Q05D32 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms