Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms