Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACVR1Q04771 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACVR1Q04771 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACVR1Q04771 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1Q04771 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACVR1Q04771 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACVR1Q04771 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ACVR1Q04771 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ACVR1Q04771 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ACVR1Q04771 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACVR1Q04771 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACVR1Q04771 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACVR1Q04771 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACVR1Q04771 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ACVR1Q04771 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACVR1Q04771 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACVR1Q04771 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACVR1Q04771 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACVR1Q04771 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACVR1Q04771 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACVR1Q04771 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACVR1Q04771 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ACVR1Q04771 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACVR1Q04771 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACVR1Q04771 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACVR1Q04771 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACVR1Q04771 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACVR1Q04771 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACVR1Q04771 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACVR1Q04771 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACVR1Q04771 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACVR1Q04771 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACVR1Q04771 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACVR1Q04771 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACVR1Q04771 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACVR1Q04771 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACVR1Q04771 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACVR1Q04771 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACVR1Q04771 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACVR1Q04771 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACVR1Q04771 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACVR1Q04771 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACVR1Q04771 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACVR1Q04771 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACVR1Q04771 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACVR1Q04771 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACVR1Q04771 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACVR1Q04771 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACVR1Q04771 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACVR1Q04771 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACVR1Q04771 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACVR1Q04771 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACVR1Q04771 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACVR1Q04771 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACVR1Q04771 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACVR1Q04771 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACVR1Q04771 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACVR1Q04771 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACVR1Q04771 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACVR1Q04771 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms