Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	PPZ1	YML016C	2079 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	PHO5	YBR093C	1404 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	PDS1	YDR113C	1122 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	YJL175W	YJL175W	513 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	YPR078C	YPR078C	1119 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	YPR136C	YPR136C	513 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	FLO10	YKR102W	3510 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	PKH1	YDR490C	2301 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	BCS1	YDR375C	1371 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	ISM1	YPL040C	3009 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	IZH1	YDR492W	951 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	RPS8B	YER102W	603 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	YGL074C	YGL074C	327 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	YJR071W	YJR071W	369 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	ENT3	YJR125C	1227 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	COA4	YLR218C	453 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	YAR075W	YAR075W	474 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	RPS8A	YBL072C	603 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	REX4	YOL080C	870 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	SYC1	YOR179C	567 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	NIP7	YPL211W	546 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	SLM2	YNL047C	1971 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	CET1	YPL228W	1650 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	VAC8	YEL013W	1737 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	SIN4	YNL236W	2925 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	RPN2	YIL075C	2838 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	TLG1	YDR468C	675 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	COX2	Q0250	756 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	YOL118C	YOL118C	309 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	RPN8	YOR261C	1017 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	MRP2	YPR166C	348 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	KRE5	YOR336W	4098 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	SEA4	YBL104C	3117 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	SEC6	YIL068C	2418 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	YOR296W	YOR296W	3870 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	HCA4	YJL033W	2313 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	POL3	YDL102W	3294 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	MRH1	YDR033W	963 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	PHM6	YDR281C	315 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	YDR340W	YDR340W	303 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	ARC19	YKL013C	516 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	SED5	YLR026C	1023 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	SLI1	YGR212W	1407 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	ARO1	YDR127W	4767 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	YPR022C	YPR022C	3402 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	NHP10	YDL002C	612 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	PAM1	YDR251W	2493 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	FLO5	YHR211W	3228 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	MRPS8	YMR158W	468 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	ATG16	YMR159C	453 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	ERG2	YMR202W	669 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	YOR082C	YOR082C	342 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	BAG7	YOR134W	1230 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	SPP381	YBR152W	876 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	MRPL27	YBR282W	441 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	ARG5,6	YER069W	2592 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	PBI1	YPL272C	1554 nt		3.9	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	DBP10	YDL031W	2988 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	AML1	YGR001C	747 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	YHR022C	YHR022C	771 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	PAN5	YHR063C	1140 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	YIL156W-A	YIL156W-A	402 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	RPC34	YNR003C	954 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	ATG29	YPL166W	642 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	MRPS9	YBR146W	837 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	RIB5	YBR256C	717 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	ECM18	YDR125C	1362 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	NUP60	YAR002W	1620 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	NUP159	YIL115C	4383 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	QRI7	YDL104C	1224 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	MAK16	YAL025C	921 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	HOT13	YKL084W	351 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	IDP2	YLR174W	1239 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	NIS1	YNL078W	1224 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	VAM3	YOR106W	852 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	snR17a	snR17a	333 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	AEP2	YMR282C	1743 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	STE6	YKL209C	3873 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	SSM4	YIL030C	3960 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	NOP4	YPL043W	2058 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	YJR061W	YJR061W	2808 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	YIR023C-A	YIR023C-A	324 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	YKL162C	YKL162C	1209 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	RPL15A	YLR029C	615 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	TPM1	YNL079C	600 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	LDS2	YOL047C	1071 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	GCN5	YGR252W	1320 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	CAF130	YGR134W	3369 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	KRI1	YNL308C	1776 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	YHR202W	YHR202W	1809 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	MRPL11	YDL202W	750 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	ARI1	YGL157W	1044 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	YGR168C	YGR168C	1131 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	YGR190C	YGR190C	366 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	REH1	YLR387C	1299 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	GAB1	YLR459W	1185 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	GOT1	YMR292W	417 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	YNL320W	YNL320W	855 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	HUB1	YNR032C-A	222 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	XRS2	YDR369C	2565 nt		3.86	□□□□□ -1.79

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