Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOP2BQ02880 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TOP2BQ02880 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms