Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RPL6Q02878 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL6Q02878 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL6Q02878 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL6Q02878 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL6Q02878 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL6Q02878 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL6Q02878 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL6Q02878 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL6Q02878 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL6Q02878 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL6Q02878 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPL6Q02878 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL6Q02878 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL6Q02878 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL6Q02878 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL6Q02878 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL6Q02878 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL6Q02878 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL6Q02878 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL6Q02878 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL6Q02878 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL6Q02878 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL6Q02878 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL6Q02878 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPL6Q02878 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPL6Q02878 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL6Q02878 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL6Q02878 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL6Q02878 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL6Q02878 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL6Q02878 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL6Q02878 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms