Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH6A1Q02252 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms