Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms