Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFKB2Q00653 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms