Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFAMQ00059 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms