Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS9P82933 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS9P82933 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS9P82933 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS9P82933 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS9P82933 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS9P82933 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS9P82933 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS9P82933 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS9P82933 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPS9P82933 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms