Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIM1P81133 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIM1P81133 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIM1P81133 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIM1P81133 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIM1P81133 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIM1P81133 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIM1P81133 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIM1P81133 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIM1P81133 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIM1P81133 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIM1P81133 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SIM1P81133 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIM1P81133 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIM1P81133 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIM1P81133 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIM1P81133 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIM1P81133 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIM1P81133 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIM1P81133 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIM1P81133 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIM1P81133 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIM1P81133 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIM1P81133 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIM1P81133 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIM1P81133 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIM1P81133 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIM1P81133 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIM1P81133 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIM1P81133 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIM1P81133 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIM1P81133 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIM1P81133 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIM1P81133 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIM1P81133 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIM1P81133 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIM1P81133 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIM1P81133 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIM1P81133 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIM1P81133 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SIM1P81133 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIM1P81133 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIM1P81133 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIM1P81133 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIM1P81133 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SIM1P81133 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIM1P81133 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIM1P81133 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIM1P81133 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIM1P81133 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIM1P81133 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIM1P81133 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIM1P81133 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIM1P81133 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIM1P81133 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIM1P81133 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SIM1P81133 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIM1P81133 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIM1P81133 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIM1P81133 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIM1P81133 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIM1P81133 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIM1P81133 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIM1P81133 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIM1P81133 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIM1P81133 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIM1P81133 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIM1P81133 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIM1P81133 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIM1P81133 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIM1P81133 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIM1P81133 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIM1P81133 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIM1P81133 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SIM1P81133 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIM1P81133 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIM1P81133 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIM1P81133 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIM1P81133 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIM1P81133 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SIM1P81133 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIM1P81133 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SIM1P81133 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SIM1P81133 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIM1P81133 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIM1P81133 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIM1P81133 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIM1P81133 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIM1P81133 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIM1P81133 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIM1P81133 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SIM1P81133 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SIM1P81133 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIM1P81133 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIM1P81133 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIM1P81133 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIM1P81133 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIM1P81133 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIM1P81133 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SIM1P81133 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms