Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT85P78386 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT85P78386 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT85P78386 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT85P78386 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT85P78386 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT85P78386 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT85P78386 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT85P78386 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT85P78386 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT85P78386 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT85P78386 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT85P78386 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT85P78386 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT85P78386 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT85P78386 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT85P78386 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT85P78386 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT85P78386 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT85P78386 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT85P78386 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT85P78386 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT85P78386 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT85P78386 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT85P78386 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT85P78386 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT85P78386 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT85P78386 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT85P78386 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT85P78386 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT85P78386 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT85P78386 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT85P78386 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT85P78386 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT85P78386 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT85P78386 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT85P78386 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT85P78386 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT85P78386 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT85P78386 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT85P78386 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT85P78386 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT85P78386 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT85P78386 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT85P78386 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT85P78386 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT85P78386 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT85P78386 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT85P78386 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT85P78386 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT85P78386 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT85P78386 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT85P78386 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT85P78386 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT85P78386 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT85P78386 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT85P78386 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT85P78386 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT85P78386 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT85P78386 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT85P78386 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT85P78386 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT85P78386 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT85P78386 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT85P78386 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT85P78386 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT85P78386 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT85P78386 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT85P78386 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT85P78386 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT85P78386 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT85P78386 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT85P78386 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT85P78386 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT85P78386 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT85P78386 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT85P78386 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT85P78386 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT85P78386 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT85P78386 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT85P78386 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT85P78386 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT85P78386 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT85P78386 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT85P78386 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT85P78386 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT85P78386 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT85P78386 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT85P78386 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT85P78386 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT85P78386 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT85P78386 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT85P78386 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT85P78386 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT85P78386 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT85P78386 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT85P78386 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT85P78386 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT85P78386 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT85P78386 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms