Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBBP68871 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBBP68871 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBBP68871 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBBP68871 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBBP68871 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBBP68871 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBBP68871 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBBP68871 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBBP68871 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBBP68871 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBBP68871 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBBP68871 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBBP68871 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBBP68871 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBBP68871 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBBP68871 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBBP68871 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBBP68871 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HBBP68871 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HBBP68871 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HBBP68871 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HBBP68871 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HBBP68871 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HBBP68871 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HBBP68871 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HBBP68871 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HBBP68871 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HBBP68871 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HBBP68871 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HBBP68871 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HBBP68871 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HBBP68871 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HBBP68871 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HBBP68871 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HBBP68871 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HBBP68871 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HBBP68871 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HBBP68871 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HBBP68871 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HBBP68871 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HBBP68871 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HBBP68871 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HBBP68871 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HBBP68871 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HBBP68871 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HBBP68871 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HBBP68871 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms