Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P62891 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P62891 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P62891 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P62891 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P62891 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P62891 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P62891 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P62891 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P62891 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P62891 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P62891 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P62891 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P62891 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P62891 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P62891 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P62891 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39P62891 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL39P62891 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL39P62891 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL39P62891 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL39P62891 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39P62891 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P62891 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P62891 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P62891 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P62891 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P62891 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P62891 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P62891 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P62891 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P62891 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P62891 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P62891 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P62891 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P62891 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39P62891 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39P62891 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39P62891 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39P62891 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39P62891 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39P62891 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P62891 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P62891 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P62891 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P62891 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P62891 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P62891 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P62891 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P62891 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P62891 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P62891 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P62891 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms