Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO4P61968 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO4P61968 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMO4P61968 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO4P61968 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO4P61968 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO4P61968 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO4P61968 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO4P61968 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO4P61968 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO4P61968 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO4P61968 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO4P61968 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO4P61968 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO4P61968 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMO4P61968 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LMO4P61968 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LMO4P61968 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LMO4P61968 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LMO4P61968 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms