Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms