Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF3P61204 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF3P61204 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF3P61204 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF3P61204 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF3P61204 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF3P61204 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF3P61204 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF3P61204 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF3P61204 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF3P61204 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF3P61204 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF3P61204 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF3P61204 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF3P61204 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF3P61204 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF3P61204 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF3P61204 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF3P61204 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF3P61204 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF3P61204 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARF3P61204 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARF3P61204 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF3P61204 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF3P61204 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF3P61204 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF3P61204 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF3P61204 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF3P61204 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF3P61204 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF3P61204 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF3P61204 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF3P61204 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF3P61204 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF3P61204 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF3P61204 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF3P61204 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARF3P61204 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF3P61204 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF3P61204 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF3P61204 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF3P61204 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF3P61204 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF3P61204 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF3P61204 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF3P61204 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF3P61204 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF3P61204 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF3P61204 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF3P61204 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF3P61204 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARF3P61204 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARF3P61204 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARF3P61204 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARF3P61204 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARF3P61204 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARF3P61204 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARF3P61204 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARF3P61204 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARF3P61204 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARF3P61204 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ARF3P61204 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARF3P61204 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARF3P61204 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARF3P61204 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARF3P61204 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARF3P61204 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARF3P61204 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARF3P61204 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARF3P61204 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARF3P61204 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARF3P61204 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARF3P61204 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARF3P61204 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARF3P61204 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARF3P61204 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARF3P61204 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARF3P61204 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARF3P61204 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARF3P61204 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARF3P61204 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms