Protein–RNA interactions for Protein: P59901

LILRA4, Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LILRA4P59901 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LILRA4P59901 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LILRA4P59901 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LILRA4P59901 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LILRA4P59901 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms