Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2BFSP57053 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms