Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAV3P56539 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAV3P56539 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAV3P56539 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAV3P56539 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAV3P56539 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV3P56539 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV3P56539 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV3P56539 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV3P56539 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV3P56539 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV3P56539 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV3P56539 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV3P56539 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV3P56539 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV3P56539 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV3P56539 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV3P56539 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV3P56539 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV3P56539 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV3P56539 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV3P56539 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV3P56539 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV3P56539 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV3P56539 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms