Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A2P55011 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A2P55011 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A2P55011 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A2P55011 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A2P55011 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A2P55011 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A2P55011 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A2P55011 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A2P55011 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A2P55011 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A2P55011 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A2P55011 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A2P55011 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A2P55011 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A2P55011 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A2P55011 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A2P55011 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A2P55011 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A2P55011 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A2P55011 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A2P55011 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A2P55011 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A2P55011 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A2P55011 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A2P55011 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A2P55011 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms