Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN5P54829 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms