Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP2S1P53680 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP2S1P53680 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms