Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRYBA4P53673 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms