Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP11P51784 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP11P51784 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP11P51784 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP11P51784 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP11P51784 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP11P51784 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP11P51784 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP11P51784 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP11P51784 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP11P51784 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP11P51784 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP11P51784 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP11P51784 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP11P51784 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP11P51784 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP11P51784 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP11P51784 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP11P51784 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP11P51784 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP11P51784 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP11P51784 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP11P51784 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP11P51784 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP11P51784 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP11P51784 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP11P51784 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP11P51784 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP11P51784 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP11P51784 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP11P51784 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP11P51784 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP11P51784 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP11P51784 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP11P51784 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP11P51784 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP11P51784 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP11P51784 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP11P51784 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP11P51784 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP11P51784 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP11P51784 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP11P51784 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP11P51784 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP11P51784 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP11P51784 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP11P51784 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP11P51784 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP11P51784 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP11P51784 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP11P51784 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP11P51784 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP11P51784 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP11P51784 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP11P51784 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP11P51784 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP11P51784 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP11P51784 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP11P51784 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP11P51784 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP11P51784 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP11P51784 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP11P51784 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP11P51784 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP11P51784 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP11P51784 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP11P51784 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP11P51784 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP11P51784 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP11P51784 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP11P51784 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP11P51784 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP11P51784 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP11P51784 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP11P51784 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP11P51784 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP11P51784 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP11P51784 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP11P51784 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP11P51784 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP11P51784 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP11P51784 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP11P51784 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP11P51784 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP11P51784 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP11P51784 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP11P51784 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP11P51784 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP11P51784 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP11P51784 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP11P51784 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP11P51784 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP11P51784 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP11P51784 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP11P51784 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP11P51784 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP11P51784 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP11P51784 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP11P51784 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP11P51784 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms