Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCNN1GP51170 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCNN1GP51170 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms