Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB5CP51148 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB5CP51148 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms