Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PPT1P50897 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPT1P50897 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPT1P50897 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPT1P50897 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPT1P50897 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPT1P50897 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPT1P50897 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPT1P50897 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPT1P50897 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPT1P50897 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPT1P50897 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPT1P50897 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPT1P50897 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPT1P50897 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPT1P50897 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPT1P50897 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPT1P50897 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPT1P50897 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPT1P50897 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPT1P50897 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPT1P50897 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPT1P50897 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPT1P50897 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPT1P50897 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPT1P50897 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPT1P50897 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPT1P50897 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPT1P50897 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPT1P50897 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPT1P50897 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPT1P50897 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPT1P50897 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPT1P50897 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPT1P50897 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPT1P50897 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPT1P50897 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPT1P50897 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPT1P50897 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPT1P50897 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPT1P50897 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPT1P50897 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPT1P50897 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPT1P50897 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPT1P50897 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPT1P50897 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPT1P50897 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPT1P50897 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPT1P50897 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPT1P50897 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPT1P50897 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPT1P50897 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPT1P50897 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPT1P50897 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPT1P50897 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPT1P50897 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPT1P50897 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPT1P50897 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPT1P50897 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPT1P50897 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPT1P50897 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPT1P50897 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPT1P50897 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPT1P50897 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPT1P50897 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms